Para peneliti di Sant Pau Research Institute, yang dipimpin oleh Dr. Ricard Rojas-García, telah menemukan mutasi baru pada gen ARPP21 yang dapat menyebabkan ALS, khususnya di daerah dengan insiden tinggi di La Rioja, Spanyol. Temuan ini, melalui pengurutan genom lengkap dari kasus familial dan non-familial, menunjukkan ARPP21 sebagai gen baru yang terkait dengan ALS. Implikasi dari penemuan ini signifikan, menawarkan prospek untuk diagnosis yang lebih baik, konseling genetik, dan potensi arah penelitian baru dalam pengobatan ALS secara global.
Penelitian dari Institut Penelitian Sant Pau (IR Sant Pau) telah menemukan gen yang terkait dengan sklerosis lateral amiotrofik (ALS).
Para peneliti yang dipimpin oleh ahli saraf Dr. Ricard Rojas-García dari Kelompok Penyakit Neuromuskular dan Kelompok Neurobiologi Demensia dari Institut Penelitian Sant Pau (IR Sant Pau), bersama dengan Unit Memori Rumah Sakit Sant Pau, telah mengidentifikasi mutasi baru pada gen ARPP21 yang dapat menjadi penyebab Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS), penyakit neurodegeneratif yang mematikan.
Secara khusus, ini adalah mutasi bersama (c.1586C>T; p.Pro529Leu) pada gen ARPP21 yang mengkode RNA-protein pengikat dan telah ditemukan pada total 10 pasien ALS dari 7 keluarga yang tidak berhubungan di suatu wilayah di tenggara komunitas otonom La Rioja.
Investigasi ini dimulai setelah mendeteksi jumlah kasus ALS yang luar biasa tinggi di La Rioja, khususnya di wilayah tenggara komunitas otonom tersebut. Jumlah kasus yang teridentifikasi di area tersebut, khususnya kasus familial, dan insiden minimum yang dihitung jauh melampaui jumlah kasus yang diperkirakan selama periode studi mengingat data insiden yang biasa, yang biasanya berkisar antara dua hingga tiga kasus per 100.000 penduduk per tahun.
“Kami melihat banyak pasien dari daerah ini, dari kota-kota yang sangat dekat, yang menarik banyak perhatian,” jelas Dr. Ricard Rojas-García, peneliti di Kelompok Penyakit Neuromuskular IR dan salah satu penulis utama penelitian ini.
Metodologi Penelitian Genetika
Antara 5% dan 10% kasus ALS memiliki riwayat penyakit dalam keluarga, dan dalam 30% kasus ini, penyebab genetik yang mendasarinya tidak dapat diidentifikasi setelah penelitian ekstensif terhadap gen-gen yang diketahui terkait dengan ALS hingga saat ini. Tujuan para peneliti Sant Pau adalah untuk mengidentifikasi gen-gen baru yang terkait dengan ALS dalam kasus-kasus yang hasil tes genetiknya negatif, yang dimotivasi oleh insiden ALS yang meningkat secara signifikan di wilayah geografis kecil Spanyol ini.
Para ilmuwan melakukan pengurutan genom secara menyeluruh pada sekelompok 12 pasien ALS (5 di antaranya memiliki riwayat keluarga) dari area unik ini. Penelitian diperluas untuk mencakup anggota keluarga yang terkena dampak dan kasus tambahan dari wilayah sekitar yang lebih luas. Mutasi yang diidentifikasi dalam ARPP21 belum ditemukan pada gen penyebab ALS lainnya. Temuan ini sangat menunjukkan bahwa ARPP21 adalah gen penyebab ALS yang baru.
Wilayah tenggara komunitas La Rioja adalah wilayah seluas 1.219,42 km². Antara tahun 2009 dan 2022, jumlah penduduk rata-ratanya adalah 43.433 jiwa, yang 31.324 di antaranya berusia di atas 18 tahun. Kepadatan penduduknya adalah 35,62 jiwa/km². Ini adalah wilayah dengan tingkat emigrasi yang tinggi, jadi mungkin ada kasus di seluruh negara bagian.
Dr. Oriol Dols-Icardo, Dr. Ricard Rojas. Kredit: Karla Islas Pieck IR Sant Pau
Mengingat insiden ALS rata-rata 1,4–2,47 kasus/100.000 orang/tahun, kami menghitung jumlah kasus yang diharapkan sebesar 0,44–0,77 per tahun di wilayah ini, setara dengan 5-10 pasien selama periode penelitian (2009-2022). Dengan mengacu pada kasus ALS familial, dengan asumsi frekuensi 5-10%, jumlah kasus yang diharapkan di wilayah tersebut adalah 0,02-0,08 kasus/tahun atau satu kasus baru setiap 12,5-50 tahun.
Meskipun demikian, antara tahun 2009 dan 2022, 15 pasien dari area studi yang memenuhi kriteria diagnostik ALS telah dikunjungi di Sant Pau. 7 dari 15 (46,6%) memiliki riwayat keluarga ALS dan dianggap sebagai kemungkinan kasus familial. Mutasi penyebab penyakit yang diketahui telah disingkirkan melalui analisis sekuensing eksom atau panel gen khusus.
“Mutasi ini tidak hanya akan membantu mendiagnosis ALS dengan lebih tepat, tetapi juga membuka pintu untuk meneliti terapi baru yang dipersonalisasi dan mempelajari fungsi protein ini dalam penyakit ini,” imbuh Dr. Oriol Dols-Icardo, seorang peneliti di kelompok Neurobiologi Demensia dan Unit Memori di IR Sant Pau dan penanda tangan pertama penelitian ini.
Dr. Dols-Icardo yakin bahwa temuan ini dapat membuka jalan baru untuk diagnosis dan pengobatan ALS. Identifikasi ARPP21 sebagai gen penyebab menggarisbawahi pentingnya penelitian lanjutan di wilayah geografis tertentu untuk menemukan faktor genetik baru.
Implikasi global
Meskipun penemuan ini hanya terjadi di satu wilayah tertentu di Spanyol, para peneliti percaya bahwa hal ini dapat berdampak secara global. “Hal ini membuka peluang bagi tim peneliti lain di seluruh dunia untuk meninjau basis data dan pasien mereka guna melihat apakah mutasi ini juga terjadi di tempat lain,” jelas mereka.
Penemuan gen baru yang dikaitkan dengan ALS tidak hanya akan memungkinkan diagnosis dan konseling genetik yang lebih baik bagi keluarga yang terkena dampak tetapi juga membuka jalan penelitian baru tentang fungsi protein spesifik ini dan hubungannya dengan penyakit tersebut.
Kemajuan ini menyoroti pentingnya penelitian genetik dalam pemahaman dan pengobatan penyakit langka dan menyoroti perlunya terus mengeksplorasi penyebab genetik ALS untuk dapat mengembangkan pengobatan yang lebih efektif di masa mendatang.
Referensi: “Identifikasi mutasi patogen pada ARPP21 pada pasien dengan amyotrophic lateral sclerosis” oleh Oriol Dols-Icardo, Álvaro Carbayo, Ivonne Jericó, Olga Blasco-Martínez, Esther Álvarez-Sánchez, Maria Angeles López Pérez, Sara Bernal, Benjamín Rodríguez- Santiago, Ivon Cusco, Janina Turon-Sans, Manuel Cabezas-Torres, Marta Caballero-Ávila, Ana Vesperinas, Laura Llansó, Inmaculada Pagola-Lorz, Laura Torné, Natalia Valle-Tamayo, Laia Muñoz, Sara Rubio-Guerra, Ignacio Illán- Gala, Elena Cortés-Vicente, Ellen Gelpi dan Ricard Rojas-García, 2 Juli 2024, Jurnal Neurologi, Bedah Saraf & Psikiatri.
DOI: 10.1136/jnnp-2024-333834