Ilmuwan Menemukan 17 Varian Genetik Baru yang Terkait dengan Penyakit Alzheimer
Penelitian terbaru telah mengungkap varian genetik yang terkait dengan risiko penyakit Alzheimer, menggunakan pengurutan seluruh genom untuk memberikan wawasan baru mengenai jalur pengobatan potensial. Studi ini menyoroti pentingnya keragaman dalam penelitian genetik dan bertujuan untuk mengeksplorasi lebih lanjut varian tersebut dalam penelitian masa depan.
Sebuah studi baru-baru ini menggunakan pengurutan seluruh genom untuk secara akurat mengidentifikasi gen tertentu dan perubahan genetik di wilayah yang sebelumnya terkait Alzheimer penyakit, yang bertujuan untuk memandu pengembangan pendekatan pengobatan dan pencegahan di masa depan.
Mengungkap varian genetik yang berkontribusi terhadap kemungkinan berkembangnya penyakit Alzheimer adalah kunci untuk meningkatkan pemahaman kita tentang cara mengelola gangguan neurodegeneratif yang tidak dapat disembuhkan ini. Sebuah studi kolaboratif antara Boston University School of Public Health (BUSPH) dan UTHealth Houston School of Public Health telah menunjukkan beberapa varian genetik yang dapat mempengaruhi risiko Alzheimer, sehingga mendorong para ilmuwan selangkah lebih dekat untuk mengidentifikasi mekanisme biologis yang dapat ditargetkan dalam pengembangan penyakit Alzheimer. pengobatan dan strategi pencegahan.
Diterbitkan di jurnal Alzheimer & Demensia: Jurnal Asosiasi Alzheimer, penelitian ini menggunakan pengurutan seluruh genom dan mengidentifikasi 17 varian signifikan yang terkait dengan penyakit Alzheimer di lima wilayah genom. Data ini memungkinkan para peneliti untuk menentukan gen dan varian yang langka dan penting, berdasarkan studi asosiasi genom, yang hanya berfokus pada varian dan wilayah umum.
Temuan ini menggarisbawahi pentingnya data pengurutan seluruh genom dalam memperoleh wawasan yang telah lama dicari mengenai penyebab utama dan faktor risiko penyakit Alzheimer, yang merupakan penyebab kematian kelima di antara orang berusia 65 tahun ke atas di Amerika Serikat. Sebagai bentuk demensia yang paling umum, penyakit Alzheimer saat ini menyerang lebih dari 6 juta orang Amerika dan jumlah tersebut diperkirakan akan meroket hingga hampir 13 juta pada tahun 2050.
“Studi asosiasi genom sebelumnya yang menggunakan varian umum telah mengidentifikasi wilayah genom, dan terkadang gen, yang terkait dengan penyakit Alzheimer,” kata rekan penulis senior studi tersebut, Dr. Anita DeStefano, profesor biostatistik di BUSPH. “Data sekuens genom keseluruhan menginterogasi setiap pasangan basa dalam genom manusia dan dapat memberikan lebih banyak informasi tentang perubahan genetik spesifik mana di suatu wilayah yang mungkin berkontribusi terhadap risiko atau perlindungan penyakit Alzheimer.”
Nilai Keanekaragaman dalam Penelitian Genetik
Untuk penelitian ini, para peneliti melakukan analisis asosiasi varian tunggal dan tes asosiasi agregasi varian langka menggunakan data pengurutan seluruh genom dari Proyek Pengurutan Penyakit Alzheimer (ADSP), sebuah inisiatif genetika yang Institut Kesehatan Nasional dikembangkan pada tahun 2012 sebagai bagian dari tujuan Undang-Undang Proyek Alzheimer Nasional untuk mengobati dan mencegah penyakit ini. Data ADSP mencakup lebih dari 95 juta varian di antara 4.567 peserta dengan atau tanpa penyakit tersebut.
Di antara 17 varian signifikan yang dikaitkan dengan penyakit Alzheimer, adalah KAT8 Varian ini merupakan salah satu varian yang paling menonjol karena dikaitkan dengan penyakit baik dalam analisis varian tunggal maupun varian langka. Para peneliti juga menemukan hubungan dengan beberapa hal langka TREM2 varian.
“Dengan menggunakan pengurutan seluruh genom dalam sampel yang beragam, kami tidak hanya dapat mengidentifikasi varian genetik baru yang terkait dengan risiko penyakit Alzheimer di wilayah genetik yang diketahui, namun juga mengkarakterisasi apakah hubungan yang diketahui dan baru tersebut tersebar di seluruh populasi,” kata rekan studi tersebut. penulis utama dan koresponden Dr. Chloé Sarnowski, asisten profesor di Departemen Epidemiologi di UTHealth Houston School of Public Health.
ADSP mencakup peserta yang beragam secara etnis, dan penilaian populasi spesifik berfokus pada subkelompok Kulit Putih/keturunan Eropa, Kulit Hitam/Afrika-Amerika, dan Hispanik/Latin, serta meta-analisis multi-populasi. Secara historis, populasi kulit hitam dan Latin kurang terwakili dalam studi genetik penyakit Alzheimer meskipun prevalensi penyakit ini lebih tinggi dibandingkan kelompok etnis lain.
“Memasukkan peserta yang mewakili keturunan genetik yang beragam dan lingkungan yang beragam dalam hal faktor penentu sosial kesehatan adalah penting untuk memahami spektrum penuh risiko penyakit Alzheimer, karena prevalensi penyakit dan frekuensi varian genetik dapat berbeda antar populasi,” kata Dr.DeStefano. Ukuran sampel dalam analisis spesifik populasi kecil, sehingga tim memiliki kemampuan terbatas untuk mendeteksi hubungan, katanya, “tetapi kami mereplikasi perbedaan populasi yang diketahui untuk APOE gen, yang merupakan salah satu gen risiko paling terkenal dan terkuat untuk penyakit Alzheimer.”
Arah Masa Depan dalam Penelitian Genetik Penyakit Alzheimer
Dalam penelitian selanjutnya, para peneliti berharap dapat memeriksa varian spesifik populasi yang mereka identifikasi dalam ukuran sampel yang jauh lebih besar, serta mengeksplorasi bagaimana varian tersebut memengaruhi fungsi biologis.
“Kami saat ini sedang berupaya memperluas penelitian ini agar dapat menggunakan pengurutan seluruh genom dengan ukuran sampel yang lebih besar di ADSP agar dapat melihat keseluruhan varian genetik, tidak hanya di wilayah genetik penyakit Alzheimer yang diketahui, namun juga di seluruh wilayah genetik penyakit Alzheimer. genom,” kata rekan penulis senior Dr. Gina Peloso, profesor biostatistik di BUSPH.
Referensi: “Varian utama melalui seluruh data urutan genom Proyek Pengurutan Penyakit Alzheimer” oleh Yanbing Wang, Chloe Sarnowski, Honghuang Lin, Achilleas N. Pitsillides, Nancy L. Heard-Costa, Seung Hoan Choi, Dongyu Wang, Joshua C. Bis, Elizabeth E. Blue, , Eric Boerwinkle, Philip L. De Jager, Myriam Fornage, Ellen M. Wijsman, Sudha Seshadri, Jose Dupuis, Gina M. Peloso, Anita L. DeStefano dan , 21 Maret, Alzheimer & Demensia.
DOI: 10.1002/alz.13705
Penelitian ini juga dipimpin oleh Yanbing Wang saat dia menjadi mahasiswa PhD di bidang biostatistik di BUSPH. Hal ini didanai oleh Institut Nasional Penuaan dengan Nomor Penghargaan U01 AG058589 dan U01 AG068221.
RisalahPos.com Network
Related posts
# PARTNERSHIP
