Penelitian mengungkapkan bahwa teknologi genotipe mengidentifikasi varian Covid dengan lebih cepat dan lebih terjangkau dibandingkan pengurutan seluruh genom, sehingga memungkinkan respons kesehatan masyarakat yang lebih cepat dan memiliki implikasi yang lebih luas untuk pengendalian penyakit di masa depan. Kredit: SciTechDaily.com
Teknologi genotipe mempercepat deteksi varian Covid, menawarkan alternatif yang lebih efisien dan hemat biaya dibandingkan pengurutan seluruh genom untuk pengambilan keputusan kesehatan masyarakat.
Teknologi genotipe mendeteksi varian Covid lebih cepat dan murah dibandingkan sebelumnya – menurut penelitian dari University of East Anglia dan Badan Keamanan Kesehatan Inggris.
Sebuah studi baru yang diterbitkan pada 17 Januari mengungkapkan bahwa teknik ini mendeteksi varian baru hampir seminggu lebih cepat dibandingkan metode pengurutan seluruh genom tradisional.
Tim peneliti mengatakan bahwa genotipe memungkinkan informasi varian Covid lebih cepat dideteksi dan dikomunikasikan kepada para profesional perlindungan kesehatan garis depan pada puncak pandemi.
Yang terpenting, hal ini membantu penerapan langkah-langkah pengendalian lokal seperti pelacakan kontak dengan lebih cepat.
Keuntungan Genotipe Dibandingkan Pengurutan Seluruh Genom
Peneliti utama Prof Iain Lake, dari Fakultas Ilmu Lingkungan UEA, mengatakan: “Ketika pandemi Covid dimulai, varian yang menyebabkan seseorang terinfeksi pada awalnya ditentukan menggunakan teknik yang sangat akurat yang dikenal sebagai pengurutan genom secara keseluruhan.
“Ini adalah alat diagnostik standar terbaik untuk mengidentifikasi dan mengkarakterisasi varian secara genetik. Namun ketika populasi yang besar perlu dikaji dengan cepat – maka biaya, kapasitas dan ketepatan waktu akan membatasi kegunaannya.
“Pada awal tahun 2021, teknologi baru untuk mendeteksi varian baru dengan cepat sedang diuji coba oleh pemerintah di laboratorium Tes dan Penelusuran NHS.
“Teknologi ini – yang dikenal sebagai ‘pengujian uji genotipe’ atau genotipe – memungkinkan para ilmuwan mengeksplorasi varian genetik.”
Neil Bray, dari Badan Keamanan Kesehatan Inggris (UKHSA), mengatakan: “Kami ingin mengetahui bagaimana teknologi ini dibandingkan dengan pengurutan seluruh genom tradisional.”
Temuan Penelitian dan Implikasinya di Masa Depan
Tim peneliti mempelajari data lebih dari 115.000 kasus di mana informasi varian Covid tersedia baik dari genotipe maupun pengurutan seluruh genom.
Dengan membandingkan hasil varian dari genotipe dengan hasil sekuensing seluruh genom, mereka menunjukkan bahwa hasil genotipe tersebut sangat akurat.
Prof Lake berkata: “Kami menemukan bahwa genotipe mampu mendeteksi varian Covid yang diketahui dengan lebih cepat dan murah dibandingkan pengurutan seluruh genom.
“Mereka menghasilkan hasil varian enam hari lebih cepat dibandingkan pengurutan seluruh genom – dengan hasil yang diperoleh hanya dalam tiga hari, dibandingkan dengan sembilan hari untuk pengurutan seluruh genom.
“Genotipe memungkinkan peningkatan sembilan kali lipat dalam jumlah sampel yang diuji untuk varian. Ini berarti varian terdeteksi pada lebih banyak orang.
“Langkah-langkah pengendalian lokal seperti pelacakan kontak dapat dilakukan dengan lebih cepat.
“Genotipe dapat diterapkan untuk menemukan varian berbagai organisme pada manusia dan hewan – sehingga genotipe memiliki potensi besar untuk memandu pengambilan keputusan kesehatan masyarakat dan pengendalian penyakit secara global di masa depan.”
Profesor Susan Hopkins, Kepala Penasihat Medis UKHSA, mengatakan: “Keahlian genomik terkemuka di dunia yang dapat dimanfaatkan oleh UKHSA dan institusi lain di Inggris selama pandemi ini sangat penting bagi respons Inggris terhadap virus. COVID 19.
“Penelitian seperti ini akan membantu kami terus mengembangkan kemampuan kami di bidang ini dan memastikan bahwa Inggris siap untuk merespons dengan cepat terhadap ancaman yang muncul terhadap kesehatan masyarakat di masa depan.”
Profesor Dame Anna Dominiczak, Kepala Ilmuwan Kesehatan di Skotlandia yang sebelumnya memimpin operasi pemerintah Inggris untuk memperluas dan menjalankan laboratorium mercusuar Covid, mengatakan: “Penelitian seperti ini sangat penting untuk memastikan bahwa kita memanfaatkan kemajuan besar dalam pengujian yang terjadi. selama Covid untuk meningkatkan pertahanan kita terhadap ancaman pandemi di masa depan.”
Referensi: “Tes genotipe RT-PCR untuk mengidentifikasi SARS-CoV-2 varian di Inggris pada tahun 2021: studi desain dan evaluasi retrospektif” oleh Neil Bray, Will Sopwith, Matt Edmunds, Harper Vansteenhouse, Jelena DM Feenstra, Peter Jacobs, Kamal Rajput, Anne Marie O’Connell, Melanie L Smith, Paula Blomquist, Diane Hatziioanou, Richard Elson, Roberto Vivancos, Eileen Gallagher, Mark J Wigglesworth, Anna Dominiczak, Susan Hopkins dan Iain R Lake, 17 Januari 2024, Lancet Mikroba.
DOI: 10.1016/S2666-5247(23)00320-8
Pekerjaan ini didanai oleh UKHSA dan Unit Penelitian Perlindungan Kesehatan Institut Nasional untuk Penelitian Kesehatan dan Perawatan (NIHR) dalam Kesiapsiagaan dan Tanggap Darurat.
Penelitian ini dipimpin oleh UEA bekerja sama dengan Badan Keamanan Kesehatan Inggris (UKHSA), BioClavis Ltd, Thermo Fisher Scientific (US), NHS Test and Trace, Department of Health & Social Care, National Institute for Health and Care Research ( NIHR), Alderley Lighthouse Labs Ltd, dan Universitas Glasgow.
RisalahPos.com Network
Related posts
# PARTNERSHIP
